海南省医保局合并的有关职能包括：省人社厅承担的全省城镇从业人员基本医疗保险管理、城镇居民基本医疗保险管理、生育保险管理和相关基金监管等职责；省卫生计生委承担的新型农村合作医疗管理和相关基金监管，药品、医疗器械和医用耗材采购管理以及疾病应急救助管理等职责；省民政厅承担的城乡居民医疗救助管理职责；省物价局承担的医疗服务价格制定和调整职责。

　　据海南省编办文件，海南省医保局主要职责包括：贯彻执行国家有关医疗保险、生育保险、医疗救助的法律法规和政策规定，研究拟定海南省医疗保障相关政策、规划、标准、办法并组织实施；负责监督全省医疗保障基金征缴（拨付）、支付、管理和运营；负责指导全省医疗服务价格管理；按管理权限，承担医疗服务价格的制定和调整；负责指导、监督全省医疗保障支付标准谈判和调整以及药品、医疗器械和医用耗材的联合采购、配送和结算管理；负责监督定点医疗机构服务行为，稽查稽核医疗费用；负责推进全省医疗保障信息系统的规划和建设工作等。

　　海南省医保局将内设综合处、医保基金管理处、医疗服务价格处、药械采购配送监管处4个处级机构。核定行政编制18名，从省人社厅连人带编划转7名、省卫生计生委6名、省物价局1名、省民政厅1名，另新增3名。